西元二○九六年七月，魔法科高中生的夏季最大活動——

通稱「九校戰」的全國魔法科高中親善魔法競技大會，今年也照例舉辦。

但今年的「九校戰」和以往不同，

競賽項目與規則都有所更動。

距離開賽只剩一個月的這個階段無預警地大幅變更，

各魔法科高中被迫臨時採取應對措施。

如此忙碌的某一天，

負責規畫九校戰作戰的達也收到了一封匿名電子郵件。

那封信中，暗示新的陰謀將以九校戰為舞台進行——

光鮮亮麗的競賽背後卻展開一場暗鬥。

達也穿梭在白天依然陰暗的富士人工樹海，挑戰背信的陰謀！

「第二學年系列」九校戰篇登場！